Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfip1G5E8V9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfip1G5E8V9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms