Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Usp17ldG5E8G2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp17ldG5E8G2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms