Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trip12G5E870 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trip12G5E870 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms