Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms