Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34aG3UW52 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34aG3UW52 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms