Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XntrpcF8VQM8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XntrpcF8VQM8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms