Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8444F6XS56 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8444F6XS56 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8444F6XS56 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8444F6XS56 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8444F6XS56 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8444F6XS56 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8444F6XS56 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8444F6XS56 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8444F6XS56 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8444F6XS56 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8444F6XS56 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8444F6XS56 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8444F6XS56 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8444F6XS56 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8444F6XS56 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8444F6XS56 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms