Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm29094F6Q785 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm29094F6Q785 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms