Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdzd7E9Q9W7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd7E9Q9W7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd7E9Q9W7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd7E9Q9W7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd7E9Q9W7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd7E9Q9W7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd7E9Q9W7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd7E9Q9W7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd7E9Q9W7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd7E9Q9W7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd7E9Q9W7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd7E9Q9W7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd7E9Q9W7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd7E9Q9W7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzd7E9Q9W7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzd7E9Q9W7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms