Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Urb2E9Q7L1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Urb2E9Q7L1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms