Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Arhgef5E9Q7D5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms