Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Usp31E9Q6Y8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp31E9Q6Y8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Usp31E9Q6Y8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Usp31E9Q6Y8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Usp31E9Q6Y8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Usp31E9Q6Y8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Usp31E9Q6Y8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Usp31E9Q6Y8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Usp31E9Q6Y8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Usp31E9Q6Y8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Usp31E9Q6Y8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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