Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3G8

Nup153, Nucleoporin 153, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup153E9Q3G8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nup153E9Q3G8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup153E9Q3G8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup153E9Q3G8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup153E9Q3G8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup153E9Q3G8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup153E9Q3G8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup153E9Q3G8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup153E9Q3G8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup153E9Q3G8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup153E9Q3G8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup153E9Q3G8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms