Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tarbp1E9Q368 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tarbp1E9Q368 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms