Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

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Length 4,418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hectd4E9Q2E4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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