Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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