Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt78E9Q0F0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt78E9Q0F0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms