Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ryr1E9PZQ0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ryr1E9PZQ0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ryr1E9PZQ0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ryr1E9PZQ0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ryr1E9PZQ0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ryr1E9PZQ0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ryr1E9PZQ0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ryr1E9PZQ0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ryr1E9PZQ0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ryr1E9PZQ0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ryr1E9PZQ0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ryr1E9PZQ0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ryr1E9PZQ0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ryr1E9PZQ0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ryr1E9PZQ0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ryr1E9PZQ0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms