Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sptbn4E9PX29 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sptbn4E9PX29 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms