Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc6D3YZP9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc6D3YZP9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms