Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptprz1B9EKR1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptprz1B9EKR1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms