Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cttnbp2B9EJA2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms