Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf11bB4XVQ1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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