Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Cfap58B2RW38 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms