Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd34aB2RW11 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd34aB2RW11 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd34aB2RW11 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms