Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Abcc8B2RUS7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Abcc8B2RUS7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Abcc8B2RUS7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms