Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Apba1B2RUJ5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apba1B2RUJ5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms