Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PtprbB2RU80 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PtprbB2RU80 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprbB2RU80 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprbB2RU80 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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