Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zscan5bB2RTN3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zscan5bB2RTN3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms