Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otud4B2RRE7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud4B2RRE7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms