Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uhrf1bp1B2KF50 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1bp1B2KF50 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms