Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mbd5B1AYB6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mbd5B1AYB6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mbd5B1AYB6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms