Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scml2B1AVB3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms