Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem238A9JSM3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms