Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ttll11A4Q9F4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll11A4Q9F4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms