Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ism1A2ATD1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ism1A2ATD1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms