Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Patl2A2ARM1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Patl2A2ARM1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms