Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SetxA2AKX3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SetxA2AKX3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms