Protein–RNA interactions for Protein: A2AHC3

Camsap1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap1A2AHC3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Camsap1A2AHC3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Camsap1A2AHC3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Camsap1A2AHC3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms