Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ckap5A2AGT5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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