Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc163A2AGD7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc163A2AGD7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms