Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp8nlA2ABX0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms