Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
1700023F06RikA2AB62 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700023F06RikA2AB62 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms