Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Pramef6A2A8M8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Pramef6A2A8M8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Pramef6A2A8M8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Pramef6A2A8M8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Pramef6A2A8M8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Pramef6A2A8M8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Pramef6A2A8M8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Pramef6A2A8M8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Pramef6A2A8M8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Pramef6A2A8M8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pramef6A2A8M8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef6A2A8M8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef6A2A8M8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef6A2A8M8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef6A2A8M8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef6A2A8M8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef6A2A8M8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef6A2A8M8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef6A2A8M8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef6A2A8M8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef6A2A8M8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef6A2A8M8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef6A2A8M8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef6A2A8M8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef6A2A8M8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramef6A2A8M8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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