Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prdm2A2A7B5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm2A2A7B5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms