Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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Limd1Q9QXD8 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Limd1Q9QXD8 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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