Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rabgef1Q9JM13 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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