Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Usp29Q9ES63 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms