Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SgshQ9EQ08 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms