Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Ccdc47Q9D024 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 AI506816-203ENSMUST00000198461 503 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm5876-201ENSMUST00000203735 243 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 0610010F05Rik-202ENSMUST00000093267 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm23638-201ENSMUST00000175073 126 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm23158-201ENSMUST00000175076 126 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm22907-201ENSMUST00000175198 126 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm22625-201ENSMUST00000175382 126 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm22875-201ENSMUST00000175449 126 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm25197-201ENSMUST00000175516 126 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm27857-201ENSMUST00000176930 126 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm26268-201ENSMUST00000177685 126 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm23681-201ENSMUST00000178821 126 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Ccdc47Q9D024 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms